西元2199年(nián),來自太陽係外的敵人加米拉斯帝國(guó),為了挽救母星的危亡,開始侵略其他星球。地(dì)球軍在與加米拉斯帝國軍的交戰中慘敗,同時(shí)加米拉斯帝國軍向地(dì)球發射大量含有放射能的遊星炸彈。地球的抵抗力量越來(lái)越弱。本與加米拉斯為雙子星球的伊(yī)斯坎達爾星球仗(zhàng)義相助,向(xiàng)地球(qiú)發送了波動引擎和波動炮的(de)設計圖紙,並告知地球軍本星球擁有清除放射能的設備“宇宙清洗(xǐ)器D”。在與歐洲、美洲失(shī)去聯係的情(qíng)況下,地球防衛軍利用伊斯坎(kǎn)達(dá)爾星球提供的(de)技術將沉睡於海底的大和號改(gǎi)造為(wéi)宇宙戰艦。大和號全(quán)體乘員踏上了取回“宇(yǔ)宙清洗器D”的漫(màn)漫(màn)征程。