西元2199年,來(lái)自太陽係外的敵人加米拉斯帝國,為了挽救(jiù)母星的危亡,開始侵略其他星球。地球軍在與加米拉斯帝(dì)國軍的交戰中慘敗,同時加米拉斯帝國軍向地球(qiú)發射大量含有(yǒu)放射能的遊星(xīng)炸彈。地(dì)球的抵抗力量越來越弱。本(běn)與加米(mǐ)拉斯為雙(shuāng)子星(xīng)球的伊斯坎達爾星(xīng)球仗義相助,向地球發送(sòng)了波動引擎(qíng)和波(bō)動炮的設計圖紙,並告知地球軍本星球擁有清除放射能(néng)的設備“宇宙清洗器D”。在與歐洲、美洲(zhōu)失去聯係(xì)的情況下,地球防衛軍利用伊斯坎達(dá)爾星球提供的技術將沉睡於海底的大和號改造為(wéi)宇宙戰艦。大(dà)和(hé)號全體(tǐ)乘員踏上了(le)取回“宇宙清洗(xǐ)器D”的漫漫征程。